《九阴真经》作为贯穿“射雕三部曲”最重要的一部秘籍，影响力可谓深远。
当初黄裳总结“万寿道藏”无意中练成一身道家武学，后来与明教结仇导致他全家被杀，于是他隐居深山，苦心孤诣，用了四十年总结天下武学，是为《九阴真经》。在黄裳写完《九阴真经》以后，他就选择自尽，因为没有任何的理由可以支撑着他活下去，后来这部秘籍又流入世上。
于是，天下高手群起而争之，一时间江湖血流成河，纷争不断。而在射雕英雄传之中，第一次华山论剑的纷争，出发点就是为了九阴真经而展开的。当时的天下第一，就可以得到九阴真经的使用权！而王重阳力挫群雄，得到天下第一才得到了九阴真经。
但是，为何到了神雕侠侣中，九阴真经的地位明显下降，甚至一度都无人问津？其实是杨过在古墓中得到了九阴真经，和小龙女也只是修炼到了一半，就半途而废了。
水能载舟亦能覆舟，决定结果的的不是工具，而是人心。郭靖为国为民，心底无私，周伯通虽然执着武功，但是心思单纯，洪七公行侠仗义，有所为有所不为，南帝慈悲为怀，这些人修炼九阴真经都受益匪浅。
而到了神雕里，弘扬更多是为国为民，鞠躬尽瘁死而后已的思想。郭靖和黄蓉夫妇义守襄阳多年，不为名利，不为大宋朝廷，为的是大宋的子民能安居乐业。杨过没有那么高的思想觉悟，但也是行侠仗义，不屑与奸佞之辈为伍。 推动故事前进的线索不是武功，因此九阴真经的作用被弱化了。
其次，就是神雕侠侣中的主人公一身武功都来自于独孤求败。而且后来修炼内力的方法，也是用的独孤求败的海潮*法大**，所以说，神雕侠侣中并不是九阴真经不厉害了，而是出来新的武功可以抗衡九阴真经了，而且人们不光追求武功，追求的还有保家卫国的思想。