部门整体支出绩效指标体系目前已形成中央和地方两个层级的指标体系，但在在各地的实践中表现为形态各样，尤其是效益指标，总结有以下几种情况：
一种情况是部门绩效权重为48分：
包括部门履职情况包括年度工作完成情况、年度重点工作完成率、年度计划完成率、年度绩效管理、年度考核情况、行政效能考核等次、上级部门条线考核。
部门产出包括根据主要专项使用情况，从产出数量、质量、时效进行设置
部门效果：根据主要专项使用情况，从项目效果类指标列示，设置满意度情况：群众满意度、内部人员满意度、部门投诉及有效处置情况
可持续发展建设：管理机制创新、信息化技术应用、、业务能力提升。
一种情况是效果15分：
监督发现问题：违规率（2分）
工作成效：部门预算绩效管理考核评价（5）
评价结果应用：应用率（2分）
结果应用创新：结果应用创新（1分）
社会效益：社会公众满意度（5分）
还有一种情况是部门绩效60分：
部门绩效包括经济性、效率性、效果性和公平性四个二级指标，其中经济性包括公用经费控制率，效率性包括预算执行率、重点工作完成情况、项目完成及时性，效果性包括社会效益、经济 效 益、生态效益及可持续影响等三级指标。公平性包括群众*访信**办理情况、公众或服务对象满意度。
上述指标设置的如何，暂不评价。但有几个问题需要思考：
一是A城市和B城市（可以是紧邻城市）相同的某部门在相同年度二者的绩效差异有多大，这方面较少实证研究。
二是部门职责是否需要结合新发展理念的要求进一步完善。在评价时发现，部门职责还是多年前的沿袭。但通过整体支出评价，需要对职责提出有效的绩效建议。
三是部门的发展目标和年度任务确定需要群策群力，需要调查研究，这样整体支出绩效目标才能落到实处，评价才有意义。