什么是FASTQ格式
FASTQ格式是一种文本形式的格式，主要用于保存核酸序列和测序质量。序列和质量都用ASCII编码来表示，是目前的高通量测序结果的标准。
FASTQ格式一般有四行：
-
序列编号和描述信息，用@开头
-
序列，包括ATGC和N
-
以加号开头，是序列标示和描述
-
质量信息，与第二行的序列对应
什么是质量评分：
质量评分是一个碱基错误概率的对数值，质量得分和错误概率关系在下列表中：
Phred 质量分数
碱基错误概率
序列准确性
10
1 in 10
90 %
20
1 in 100
99 %
30
1 in 1000
99.9 %
40
1 in 10000
99.99 %
比如我们常说的Q30，就是指的质量分数在30分以上，就是序列准确性在99.9%以上的碱基在测序数据中的比例。
之前我们分享了SAM格式，回顾： 生信必会的SAM格式，该怎么看？ 如果文章对你有所帮助，请转发给你身边需要的人噢！
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