怎么检测慢病毒滴度?请收下这份protocol~

慢病毒滴度检测采用稀释计数测定法

滴度单位: TU/mL ,指每毫升中含有的具有生物活性的病毒颗粒数。“ TU ”为“ transducing units ”的缩写,中文为“转导单位”,表示可以感染并进入到靶细胞中的病毒基因组数。

I. 细胞准备

将生长状态良好的 293T 细胞消化计数后稀释至 1x10^5/mL, 加入 96 孔板, 100 μL/ 孔,为每个病毒准备 6 孔。放入 37°C 5 % CO2 培养箱中培养。

II. 加病毒

第二天,准备 6 1.5 mL EP 管,第一个 EP 管中加入 10 μL 病毒原液,然后做 3 倍梯度稀释,共 6 个稀释度。

III. 追加培养液

第三天,有需要加 puromycin 筛选的孔,先吸去 100 μL 含病毒培养基,加入 100 μL 1.5 μg/mL puromycin 10 % FBS 完全培养基。

IV. 观察结果并计算滴度

第五天,在荧光显微镜下观察结果,在观察结果前 6 h 需更换新鲜 10 % FBS 完全培养基,从孔中吸出 80 μL 培养基,然后加入 80 μL 新鲜 10 % FBS 完全培养基,放入 37°C 5 % CO2 培养箱中培养。 6 h 后荧光显微镜下观察结果,荧光或活细胞 百分比在 10~50 % 的孔计算病毒滴度。

滴度( TU/mL = 细胞数 × 阳性克隆 百分比 ×MOI× 病毒稀释倍数 ×10^3 TU/mL

常见问题解析:

Q1 protocol 中使用抗生素筛选法 计算滴度需要注意什么

A1 :抗生素浓度需要预先做实验摸好浓度,选择最低的能够 100% 杀光所有细胞的浓度。对于常见的 Puromycin 来说,测量的时间点是加药 2-3 天后, Hygromycin 是加药 4-5 天后。

Q2 :稀释计数测定法与 PCR 法测定病毒核酸量, ELISA 法测定病毒外壳蛋白量最大的区别在于?

A2 :后两种方法没有考虑慢病毒的活性,死病毒会一并被测出来。

Q3 :抗生素筛选法和荧光报告基因法有很大的区别吗?

A3 :从原理上来说,两种方法并没有本质上的区别:它们都是计算阳性细胞的比例,从而换算原始的病毒活性滴度。但是,若细胞培养的时间较长,阳性细胞比例的变异度就会增大。

荧光报告基因法的实验流程较短,在感染 48~72 小时后,待荧光基因充分表达,即可测定。 然而,抗生素法则需要等抗性基因充分表达后,再加入抗生素筛选数天,待彻底杀灭阴性细胞后,才能进行细胞计数并换算滴度。