硝化细菌：
第一种解释：是指利用氨或亚硝酸盐作为主要生存能源，以及能利用CO2作为主要碳源的细菌。硝化细菌在氮的循环中起重要的作用，它能把亚硝酸盐转化为硝酸盐，被水草和藻类利用，而起到改水的作用。另一种解释是；指能够氧化无机氮化物，从中获取能量，从而把二氧化碳合成为有机物的一类细菌。（我认为这种解释说得更清晰）。大家看 看下面的方程式就明白了。2NH3＋3O2――（亚硝化菌）――2HNO2＋2H2O＋能量（氨的氧化）2HNO2＋O2――（硝化菌）――2HNO3＋能量（亚硝酸的氧化）6CO2＋6H2O――（能量）――C6H12O6＋6O2（硝化细菌利用前面的两个反应中所放出的能量,把从外界摄取的二氧化碳和水合成为葡萄糖的过程） 硝化细菌包括亚硝化菌和硝化菌。没有一种硝化细菌能够直接把氨转变成硝酸,所以说,硝化作用必须通过这两类菌的共同作用才能完成。亚硝化菌包括：亚硝化单胞菌属、亚硝化球菌属、亚硝化螺菌属和亚硝化叶菌属中的细菌。硝化菌包括：硝化杆菌属、硝化球菌属和硝化囊菌属中的细菌。 前面这部分我说的是硝化作用，可以看到硝化细菌是一种好氧菌，它可以将水中的氨转化成硝酸（NO3），但如果水族箱里面充满NO3的话，不用我说大家也会明白会发生什么事情。下面我就说一下NO3是怎么去除的。
反硝化细菌：
是指把硝酸盐等较复杂的含氮化合物转化为N2，NO和N2O的过程． 该过程也是由细菌和真菌参与的． 反硝化作用必须在无氧或缺氧的条件下进行。反应离子方程式如下：C6H5OH＋9.33OH2－＋1.67H2O 9.33OH－＋6CO2＋ 4.67N2 (3) C6H5OH＋5.6NO3－ 5.6OH－ ＋6CO2＋0.4H2O ＋2.8N2 (4) 2NH4＋＋3O2 2NO2－＋4H＋＋2H2O (1) 2NO2－＋O2 2NO3－ (2)根据以上的说明，可以有以下简单的结论：硝化：将NH4、NH3转化成NO2、NO3反硝化：将NO2、NO3转化成N2、NO、N2O 好氧菌：硝化细菌（硝化菌、亚硝化菌）厌氧菌：反硝化细菌，（光合细菌也是一种厌氧菌） 亚硝化菌：将氨转化成NO2硝化菌：将NO2转化成NO3反硝化细菌：将NO3转化成N2、NO、N2O 在水族箱中，如果要达到稳定的去氨生化过滤，以上这些缺一不可。一般我们关心最多的是硝化细菌（其中包括了硝化菌和亚硝化菌），而忽略的反硝化菌的存在，因此导致NO3积存（这种现象在海水缸的过滤系统中比较明显），因此海水缸的硝酸盐去除器特别重要。但也有一个简单的方法可以解决，利用专门的培养厌氧菌的过滤材料（AB有一种，另外，还有一种玻璃陶瓷球）。
