兰大预测本轮疫情将于4月初得到控制,奥密克戎发生多次跨变种基因重组丨新冠研究一周进展

兰大预测本轮疫情将于4月初得到控制,奥密克戎发生多次跨变种基因重组丨新冠研究一周进展

来源:中国科讯、生命科学前沿、环球科学、科研圈、 iNature、梅斯医学、 Hanson临床科研等

  • CLYBL或是新冠治疗新靶点

兰大预测本轮疫情将于4月初得到控制,奥密克戎发生多次跨变种基因重组丨新冠研究一周进展

来源:Science China Life Sciences

近日,发表于《中国科学:生命科学》( Science China Life Sciences )的一项工作中,研究人员对比分析了86例新冠肺炎患者、55例普通肺炎患者和176例健康对照者的尿液蛋白质组,发现了一个只在患者尿液中高表达的蛋白CLYBL。

CLYBL的显著高表达会导致上游代谢产物衣康酸的消耗,而衣康酸在抗氧化、抗炎症等细胞保护方面发挥着重要作用,研究人员推测,补充衣康酸、抑制CLYBL可用来治疗新冠。

https://link.springer.com/content/pdf/10.1007/s11427-021-2070-y.pdf

  • 轻度新冠患者先天免疫能抑制病毒复制

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来源:Science Immunology

近日,发表于《科学·免疫学》( Science Immunology )的一项研究,描述了恒河猴的新冠肺炎轻度感染与其组织中抗原特异性T细胞反应前的病毒控制有关。

研究人员用恒河猴来模拟新冠病毒轻度患者组织中的初级保护性免疫反应。在肺部炎症有所缓解,病毒RNA和中干扰素激活的骨髓细胞数量大幅下降后,可在支气管肺泡灌洗液和肺组织中检测到病毒特异性效应CD8+和CD4+T细胞。表明在T细胞反应之前,新冠肺炎在恒河猴肺部的复制减弱,说明在新冠病毒轻度患者体内,先天免疫有效地限制了病毒的复制。

https://www.science.org/doi/10.1126/sciimmunol.abo0535

  • AAT可有效治疗新冠危重患者

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来源:Med

3月11日,发表于 Med 的一项研究表明,抗炎蛋白α-1抗胰蛋白(AAT)可有效治疗新冠病毒危重患者。

研究人员将健康人员血液中的AAT用于患有急性呼吸窘迫综合征(ARDS)的新冠病毒患者,以缓解新冠病毒患者体内的炎症,发现用AAT治疗一周后,新冠病毒患者体内的炎症有所缓解。此外,用AAT治疗新冠病毒患者是安全的,且耐受性良好,不会影响新冠病毒患者的自身保护性反应。这一发现表明,AAT可用于治疗ARDS和其他与新冠病毒相关的炎症性疾病。

https://doi.org/10.1016/j.medj.2022.03.001

  • 奥密克戎变异株发生多次基因重组

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来源:bioRxiv

3月14日,发表于预印本bioRxiv的一项研究,对全球出现的新冠病毒奥密克戎变异株的全基因组序列及其刺突蛋白基因序列进行了精细分析,首次发现奥密克戎发生了多次跨变种重组的可靠证据。

通过分析2020年11月至2021年1月全球发布的奥密克戎变异株的基因组序列,筛选奥密克戎变异株的S蛋白基因序列,研究团队发现奥密克戎变异株在流行期间,不断新增和整合多个非原生的来自其它既往的VOC/VOI毒株的典型氨基酸突变。部分奥密克戎变异株的S蛋白RBD区出现了L452R及R346K突变,可能是与德尔塔及缪变异株重组获得。

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.03.13.484129v1

  • 兰州大学预测中国内地本轮疫情将于4月初得到控制

兰大预测本轮疫情将于4月初得到控制,奥密克戎发生多次跨变种基因重组丨新冠研究一周进展

来源:兰州大学“新冠肺炎疫情全球预测系统”

3月14日,兰州大学“新冠肺炎疫情全球预测系统”基于实时更新的流行病数据,并考虑气候和环境条件以及政府管控措施对疫情传播的影响,发布了对2022年3月中国内地新冠肺炎疫情的初步预测结果:在当前政府采取的及时、有效的管控措施下,内地本轮疫情预计将于2022年4月初得到控制,预计累计感染约3.50万人(2.47万~4.53万)。

预测团队认为,虽然内地本轮疫情是自武汉疫情以来最严重的本土疫情,但只要坚持“外防输入、内防反弹”总策略、“动态清零”总方针不动摇、不放松,我国定能很快控制住疫情。

  • 新算法可预测新冠病毒的“低频”变体

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来源:Nature Communications

3月14日,发表于《自然·通讯》( Nature Communications )的一项研究中开发了一项电脑程序,可基于基因组信息准确识别“宿主内变异”新冠病毒的“低频变体”,为发掘现有约50万新冠病毒基因组的低频变异体提供了可能性。

研究人员利用来自病毒种群动态的信息,比较在不同时间点收集的样本或来自不同患者的样本,通过变体在样本间等位基因频率变化的趋势,首次成功通过ONT数据识别出宿主内的低频新冠变体。该程序的准确性在单一阳性患者和通过不同测序方式获得的跨患者数据集的序列中得到验证。

https://www.nature.com/articles/s41467-022-28852-1#Abs1

  • 3剂次新冠RBD蛋白疫苗足以诱导机体产生高效体液免疫

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来源:Signal Transduction and Targeted Therapy

3月14日,发表于《信号转导与靶向治疗》(Signal Transduction and Targeted Therapy)的一项研究,系统性分析了两剂次、三剂次和四剂次重组RBD疫苗叠加免疫增强佐剂CpG的效果。

研究团队系统地探究了新冠重组RBD蛋白疫苗作为佐剂在高低两种接种剂量和不同接种次数对C57BL/6小鼠免疫效果的影响。通过收集各免疫方案最后一剂次疫苗接种后14天的小鼠血清,研究团队检测RBD特异性IgG滴度和抗体的中和能力,结果显示高剂量组均优于低剂量组,且只有接种3剂次和4剂次的5RCA组的抗体中和能力显著高于其他组。

https://www.nature.com/articles/s41392-022-00937-9

  • 新冠重症患者患抑郁和焦虑的风险升高60%

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来源:Lancet Public Health

3月14日,发表于《柳叶刀·公共卫生》( Lancet Public Health )的一项研究表明,与从未诊断出新冠的参与者相比,确诊新冠的参与者抑郁症患病率更高,睡眠质量更差。

在调整混杂因素后,包括年龄、性别、教育程度、体重指数和精神病诊断史等因素,抑郁症患病率增加了18% 。随着时间的推移,长期卧床的患者与较高的心理健康影响发生率始终相关。在16个月里,与从未感染过的参与者相比,卧床7天或更长时间的患者出现抑郁和焦虑的风险增加50%~60%。

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2468266722000421

  • mRNA疫苗和灭活疫苗在抗体Fc效应方面差别巨大

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来源:Science Translational Medicine

3月15日,发表于《科学转化医学》( Science Translational Medicine )的一项研究中,报道了三种疫苗BNT162b2,mRNA-1273和CoronaVac接种引发的Fc效应。

研究发现三种疫苗接种者产生的IgM,IgA和IgG抗体与奥密克戎Spike结合能力依然较强。两种mRNA疫苗接种者RBD特异性抗体保存了FcγR2a和FcγR3a结合能力,但CoronaVac接种者则无法结合FcγR2a和FcγR3a,因此无法诱导相应的Fc效应从而起到保护作用。三种疫苗Spike特异性抗体的FcγR都下降,但CoronaVac下降最多,这导致具有保护作用的抗体依赖的细胞介导的细胞毒性效应也出现显著下降。

https://www.science.org/doi/10.1126/scitranslmed.abn9243

  • 疫苗对奥密克戎突变株亚型仍有效

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来源:NEJM

3月16日,发表于《新英格兰医学杂志》( NEJM )的一项研究,报道了接种BNT162b2疫苗对奥密克戎BA.1和BA.2两种亚型突变株的中和活性。

研究发现2剂BNT162b2疫苗接种后,接种者血清对原始毒株的假病毒中和抗体滴度平均值为658,对BA.1的中和滴度为29,对BA.2为24。加强接种第3剂BNT162b2疫苗后,对原始毒株的中和抗体滴度显著增加到了6539,对BA.1为1066,对BA.2为776。研究数据显示,BNT162b2疫苗接种后,针对奥密克戎BA.2的中和抗体滴度与BA.1相似,并没有显著降低,加强接种后可显著增高其中和抗体滴度。

https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMc2201849

  • 新冠病毒存在罕见的母婴传播情况

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来源:British Medical Journal

3月16日,发表于《英国医学杂志》( British Medical Journal )新研究表明,新冠病毒有在分娩前、分娩期间和分娩后由母亲传染给婴儿的可能,但这种情况极为罕见。

研究调查了全球14271名感染新冠的母亲所生婴儿的数据,发现1.8%的婴儿核酸检测结果为阳性,表明此类婴儿感染的风险较小。此外,病毒通过阴道分娩、皮肤接触和母乳喂养传播的风险很低。

但新冠症状较重母亲所生的婴儿更有可能检测出阳性,须要在婴儿出生后对其进行检测并密切监测。应进一步鼓励孕期接种疫苗,以预防孕妇出现感染和重症。

https://www.bmj.com/content/376/bmj-2021-067696

  • 新型蛋白质亚基疫苗有效、廉价且易于储存

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来源:Science Advances

3月16日,发表于《科学进展》( Science Advances )的一项研究中,开发了一种有效、廉价且易于储存的蛋白质亚基疫苗。

该疫苗由排列在病毒样颗粒上的新冠病毒受体结合域(RBD)和乙型肝炎表面抗原组成,可以通过毕赤酵母生产,且全球都建有这种发酵设施。

在非人类灵长类动物的小型试验中,该疫苗产生的抗体水平不低于已批准的新冠疫苗产生的抗体水平,当动物暴露于新冠病毒时,接种该疫苗的动物体内的病毒含量远低于未接种疫苗的动物。

将免疫原受体结合域附在病毒样颗粒上的方法提供了一种“即插即用”的模块化思路,将有希望研制出能针对新冠毒株变体或其他冠状病毒提供保护的加强针。

https://www.science.org/doi/10.1126/sciadv.abl6015

  • 疫情爆发导致表达情绪快速下跌

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来源:Nature Human Behavior

3月17日,发表于《自然·人类行为》( Nature Human Behavior )的一项研究发现,疫情爆发导致所有国家的表达情绪快速下跌,且恢复较慢。封城政策对大多数国家人们表达情绪有微小的正面作用,这可能反映纵容病毒传播会造成程度相当甚至更为严重的心理痛苦。

研究团队用2020年1月至5月,100多个国家1056万人在推特和微博上发表的6.54亿条贴文开发了一个机器学习模型,建立了每日情绪指数。研究人员认为,这种分析方法可能会成为政策制定者的有用工具,但社交媒体用户不具代表性,并不能完全替代传统调查手段。

https://www.nature.com/articles/s41562-022-01312-y