肠球菌最初从人的大便里分离得到，由于它的样子与链球菌相似，很长一段时间都被称为肠链球菌，可是后来人们慢慢发现它与链球菌有着很大的不同，所以现在将其单独命名为肠球菌属。肠球菌本是人和动物肠道的正常菌群之一，在健康人大便里含有大量的肠球菌，大概每1克粪便就有上百个肠球菌，不仅是肠道，人的口腔、胆囊、女性生殖道也常有该菌存在。这些肠球菌可以帮助我们发酵糖类，产生乳酸，分解蛋白质以助于消化，并且参与营养代谢。另外它还能产生一些抗菌物质，抑制有害细菌生长，保护肠道黏膜。我们日常吃的酸奶里就常常发现它的存在，从这一方面说，肠球菌对人类还是有有益的一面。
但事情往往具有两面性，肠球菌也不例外，一旦条件成熟，它就会变成致病菌，比如过量使用抗生素造成肠道菌群失调，从而使肠球菌大量繁殖，一旦超过人体承受的范围，它就会在粘附素的作用下粘附到人体细胞上，进而分泌细胞溶解素、明胶酶等一系列毒力因子来破坏正常组织，引发感染。
在肠球菌家族中有两种肠球菌，分别是粪肠球菌和屎肠球菌最为常见。粪肠球菌和屎肠球菌虽然只有一字之差，但却是两种不同的细菌。粪肠球菌在临床上引起的感染更多见，比如尿路感染、腹腔盆腔感染、败血症中都有它的踪迹；但是屎肠球菌比起粪肠球菌其耐药性更强，一旦感染，治疗难度会更大。
说起肠球菌的耐药性，着实是让临床医生头疼的一件事。肠球菌由于长期在人体的肠道中生存，面对肠道复杂的环境，它早就有了很强的适应能力，也就产生了很强的抵抗性，我们常用的青霉素、头孢菌素、庆大霉素等都很难轻易地消灭它，就连非常高级的万古霉素对有些耐药性强的肠球菌都无能为力，这让临床在治疗感染时变得非常棘手，往往需要多种抗生素联合应用才能有效地杀死它。
最后，需要我们注意的是，肠球菌的抵抗力相对于其他细菌来说是比较强的，所以需要我们特别注意，不要吃不洁净的食物，饭前便后一定要洗手。不过好在这些耐药性强的肠球菌主要在医院里面存在，日常生活中还是不容易接触到的，只要我们保持良好的个人卫生，不要稍有不适就乱用抗生素，就可以避免被肠球菌感染。