在世界的某个角落存在着一个极度神秘的组织，他们与各国的政府、政要都有着千丝万缕的联系。这个组织从世界各地搜罗孤儿，这些孩子在进入组织后便失去了自己的名字，取而代之的是头上的代号。而他们被培养成了冷酷无情的杀手，47就是其中一名杀手，他被称为幽灵杀手。
每一天他的任务就是接受*杀暗**指令，不问缘由，不问对错，只为金钱而战。他早已习惯了这样的生活，心中只有冷硬的杀意和无尽的黑暗。
某天某国总统出现在政府门前，人潮汹涌，记者云集。突然间身边的保安突然倒下，总统的视线与远处47的枪*交口**汇，一声枪响总统应声倒地，现场陷入了一片混乱。47快速地在装备中安置了*弹炸**，然后迅速离开现场。
然而事情并未就此结束，47赶往车站时组织发来消息，得知有一个叫小美的目击者。47很快找到了小美，正要掏枪解决她时小美看向了她，她的眼神中没有恐惧，没有惊讶，就像看待一个路人。47察觉不对，迅速收手。
然而下一秒一个路人替47挡住了*弹子**，对面楼上有一个光头拿枪对准了47，现场一片混乱。47趁乱离开了现场，回到了酒店。他在房门上安置了*弹炸**，阳台上放了逃生绳，然后打开了任务系统。系统发来实时新闻，总统正在接受记者采访，只是头部受了一点轻伤。
47困惑不已，他明明打中了总统头部，此时他想到了小美，意识到自己可能陷入了圈套。与此同时国际刑警大壮刚下飞机就接到了线报，得知了47的藏身之处。他带领大批警察赶到了酒店，联邦调查局的人也收到了消息前来抓捕47。两帮人迅速上楼，47被团团围住。