婴幼儿特别容易过敏，常见的以湿疹及胃肠道过敏为主，随年龄增长支气管哮喘、变应性鼻炎、过敏性结膜炎等占主要地位，约有1/5的儿童会经历这一进程。
很多人认为过敏是外部因素造成的，但近年来粪便菌群分析及流行病学调查等研究提示，儿童期过敏性疾病与早期肠道菌群的定植有关。
众多研究结果指向：
大肠杆菌的存在可增加患湿疹的风险，随着大肠杆菌数量的增加风险性也增加。
婴儿体内梭状芽孢杆菌的出现增加了患湿疹、周期性喘息和出现过敏反应的风险。
梭状芽孢杆菌的存在增加了特应性皮炎的风险性。
……
有研究证实：
有哮喘风险的婴儿双歧杆菌量少，梭状芽孢杆菌量多;
过敏婴儿6个月时双歧杆菌较少，梭状芽孢杆菌较多;
过敏婴儿24个月时双歧杆菌较少，需氧菌量多，大肠杆菌多，金黄色葡萄球菌计数较多;
以后发展为过敏性疾病的婴幼儿早期微生物（2～3周或1个月）中双歧杆菌少，物种组成少，通常青春双歧杆菌和梭状芽孢杆菌较多，24个月时差异类似，但并非显著，甚至在5岁时仍然存在。
随着对新生儿肠道菌群定植研究的深入，肠道菌群定植对人体新陈代谢、免系统及人整体健康的作用越来越重要。
在新生儿早期注意保护孩子的肠道菌群，尽量阴道分娩、科学喂养、少用抗生素等，也可适当补充适合婴幼儿的益生菌，从而来预防和对抗婴幼儿过敏。
