石子山站是在北碚东阳镇境内，2005年随遂渝铁路建成，最初曾经叫过北碚北，后来还是改名石子山。石子山站重庆端有两个方向的线路，一条侧线是接襄渝铁路的东阳线路所，2005年建成，另一条是正线，经蔡家到井口去重庆北，2006年底建成，2007年1月进行过试验，4月投入使用。2006年底到2007年初曾经开行过一趟重庆北到遂宁的慢车，重庆北出发后经井口、回龙坝、北碚、东阳线路所，在石子山也要办理上下客，这趟慢车在2007年第六次大提速调图前停运，之后石子山站再没有办理过客运业务。这座车站也就是一座办理列车会让或待避的车站，2012年遂渝二线建成，石子山站重庆端四条线接出，中间两条是去蔡家方向，边上两条去北碚方向。
2012年，动车经过站改中的石子山站
石子山站遂宁端外边有一座彩虹样式的桥，跨过渝武高速公路。
动卧通过彩虹桥
2015年随着重庆北站渝利场投用，时速200公里以上动车组都不再走石子山。更多是普速客车和货运列车，这两年有时速160公里的动力集中式动车组经过此站，此外重庆走兰渝的普速客车以及货列都要经过石子山站。
行包快运列车
石子山站重庆端
普速客车通过石子山