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内蒙古土默特左旗——喇嘛洞召庙
最初，达延汗划分的右翼三万户是：鄂尔多斯、永谢布和蒙郭勒津(明代汉籍作满官嗔)。蒙郭勒津万户位于明朝大同以北和东、西一带，原来归达延汗第四子阿尔苏博罗特所有。后来，巴尔斯博罗特济农次子阿勒坦汗实力强大，兼并了蒙郭勒津万户的大部分，只有其中的多罗土蛮部由阿尔苏博罗特之子布哲吉尔（一写不只吉儿）台吉所领有，其余各部均由阿勒坦汗及其弟拉布克台吉所占。所以，蒙郭勒津万户的名称也逐渐被阿勒坦汗所领的土默特部之名称所取代，称为土默特万户。
阿勒坦汗统帅的土默特万户，位于"大同边外，大青山、昭君墓、丰州滩"之地，西至黄河与鄂尔多斯万户为邻，东至宣府洗马林边外一带。蒙古文献和汉文史料均一致记载土默特万户分十二部，或十二鄂托克。但是，囿于史料有欠完整和准确，目前还难以确定此十二部究竟是指那些领主所属之部。所以，现将见于记载的各部均一一列出：
辛爱黄台吉部。驻牧于宣府边外之兴和(今河北省张北县)以北之小白海、马肺山一带。这里距离明朝边境150千米。辛爱黄台吉的驻地位于土默特万户的最东边，同朵颜卫的兀良哈部驻地相接。其父阿勒坦汗逝世以后，他继承其汗号，称彻辰汗。同时，他迁居于呼和浩特。
大成台吉部。大成台吉是阿勒坦汗第三子铁背台吉之子。该部驻牧于山西偏头关所边外西北之哈朗兀地方。这里距明朝边境150千米。哈朗兀在大板升城之西。大成台吉部的牧地，是土默特万户驻牧地的最西端，隔黄河与鄂尔多斯万户相望。有的学者认为，大成台吉所部即土默特万户之蒙郭勒津部。
巴岳特部(一写摆腰部)。阿勒坦汗次子布彦台吉所属之部。该部驻牧地位于大同府的天城卫(今山西省天镇县)、阳和卫(今山西省阳高县)边外的伊克掬力革一带。这里距离明朝边境也是150千米左右。布彦台吉有一子，叫巴都尔台吉。该台吉有六子，均在一处驻牧。其长子松木儿台吉在父亲死后成为巴岳特部部长。
畏兀慎部。该部是阿勒坦汗第四子丙兔台吉所率之部，其驻牧地在大成台吉部之北，亦即山西偏头关所边外，"胡地委兀儿趁"（肖大亨《北虏风俗》）。这里距离明朝边境350余千米。后来，丙兔台吉西迁青海驻牧，该部牧地遂为辛爱黄台吉长子扯力克所据。
巴林部。该部是阿勒坦汗第五子野力邓吉(汉籍称把林台吉)所属之部，其驻牧地在大同阳和正北边外的歹颜那石机之地。这里距离明朝边境250千米。野力邓吉有七子，其中哲里图台吉较为著名，在父亲死后成为巴林部部长。
邓达拉特 (打喇特)部。该部是阿勒坦汗第六子哥力各台吉所属之部，其驻牧地在大同得胜堡边外垛兰我肯山山后。其驻牧地距离明朝边境约150千米。邓达拉特部在哥力各台吉及其子达赖阿拜时期有一定的实力。达赖阿拜逝世以后，其诸子追随素囊台吉，受其节制。
兀慎(又作兀甚)部。该部系阿勒坦汗之弟剌布克台吉所领之部，其驻牧地在大同镇边堡(今山西省大同市东北)边外正北克儿一带。这里距离明朝边境不到100千米。拉布克台吉的后裔中，以其孙岱青达尔罕台吉最为著名，而且深得阿勒坦汗的信赖。1578年，阿勒坦汗等土默特万户封建领主前往青海之际，岱青达尔罕台吉代表阿勒坦汗等人主持了当时和明朝的互市和朝贡贸易等项重大事务。
多罗土蛮部。该部是达延汗第四子阿尔苏博罗特之子布哲吉尔所率之部，其驻牧地在山西偏头关所边外西北之地。这里距离明朝边境约六七百里。布哲吉尔共有七子，其中以岱雅黄台吉、麦力哥台吉、火落赤台吉和克楚台吉四子最著名。他们都曾先后西迁青海一带驻牧和活动，和卫拉特部作战。
兀鲁部。该部是辛爱黄台吉次子那木儿台吉(汉籍作五路台吉)所属之部，其驻牧地在大同天城边外正北五克儿菊儿克一带。这里距离明朝边境约250千米。那木儿台吉逝世后，其长子敖卜言台吉成为兀鲁部部长。
王吉剌部。该部是辛爱黄台吉第三子青巴都布日哈图台吉所属之部，其驻牧地在万全右卫(今河北省万全县)边外，西与兀鲁部相邻。青巴都布日哈图台吉共有七子。他们均在新平堡(位于西洋河上游)边外驻牧。
布喀勒斯部。该部是辛爱黄台吉第五子松木儿台吉所属之部，其驻牧地在宣府新河口堡边外的擦哈揉儿之地（有的学者认为擦哈揉儿即今商都县境内之察汗诺尔）。这里距离明朝边境约有100千米。松木儿台吉有四子。其第四子即是*藏西**第四世达剌喇嘛云丹嘉措。
段奈台吉部。段奈台吉(又名波尔哈兔)是辛爱黄台吉的第六子，该部驻牧于宣府膳房堡以北之马肺山一带，这里距离明朝边境100多千米。
哈木巴都尔台吉部。哈木巴都尔台吉是辛爱黄台吉的第四子，该部驻牧于山西偏头关西北边外擦哈把剌哈素一带，这里距离明朝边境130千米左右。
茂明安 (又作毛明暗)部。该部是扯力克台吉第三子茂明安所属之部，其驻牧地在柴沟堡(今河北省怀安县)西北边外草垛山一带，这里距离明朝边境约50千米。
汉籍《武备志·北虏考》载，茂明安台吉为人"姣而儇"。在卜石兔即其祖父扯力克彻辰汗位和明廷所封顺义王王位而遭到素囊台吉阻挠时，茂明安台吉曾企图静观鹬蚌相争，以坐收渔人之利。他当时百般献媚钟金夫人，"厚赂用事"，一时间"左右皆交口誉之"。钟金夫人也"密与明暗（安）约，将言于中国，以王授之"。遂将扯力克之大纛等物授予茂明安台吉。最后，因右翼首领一致拥戴卜石兔称彻辰汗和即顺义王位，毛明暗等人的计谋终致破产。
另外，土默特万户中还有杭锦部。目前还不清楚该部由谁所属及其驻牧地所在。
以上所列土默特万户各部已经超过十二部。目前还难以确定十二部是由上述诸部的哪些部构成（内蒙古社科院历史所《蒙古族通史》，民族出版社，2001年发行版）。