相比较而言，CT的准确性要高于B超，但是B超属于无创检查，所以如果怀疑有肾结石首先要做彩超检查，如果彩超怀疑有结石再进一步做CT。CT检查比B超检查更准确，CT可以发现更小的结石，清晰显示结石的具体位置。
肾结石做B超检查可以发现3mm以上的结石，但在CT中可以发现2mm至1mm左右的结石。另外，肾结石如果落入输尿管，受肠道气体的影响，容易导致B超检查困难，往往不能发现结石。而CT检查不受肠道内气体的干扰，比超声检查更准确。
多层螺旋CT处理结石的优势
多层螺旋CT因其有效的薄层及多平面重建功能、超快的扫描速度及极高的空间分辨率，可发现各种硬度的肾结石，在显示肾结石上面有其独特的优势，它除了可以显示肾结石的大小、形态、位置、分布等特点，还可以显示出因为肾结石导致的肾盂、肾盏的积水扩张情况，以及是否合并有肾脏的炎性渗出的感染性改变。
对于输尿管小结石及输尿管不扩张的中下段结石有着百分百的显示率，并能区分盆腔内静脉石及血管壁钙化，而且结石的部位、大小、形态、CT值、与周围组织解剖关系都能显示得一清二楚，通过做增强CT在肾脏注射入对比剂后，还可以了解到肾脏的显影情况，从而判断肾脏的排泄功是否有受影响，对治疗方法的选择有着重要的指导意义。
肾结石CT需要空腹么？
肾结石做CT检查的时候，一般不需要空腹，在结石的影像学检查当中，一般选择B超或者CT检查，CT检查分辨率比腹平片要高，可以发现1mm的结石，进食后对检查无影响，所以检查前可以吃饭。
肾结石经皮肾镜取石术后输尿管放置双J管后为什么要复查CT
做完经皮肾镜碎石取石手术后，肾盂输尿管粘膜可能存在水肿、损伤，放置双J 管（起输尿管支架作用的管道）有助于扩张输尿管，防止粘膜水肿出血后发生粘连狭窄，另外，碎石后有一些小的结石碎末，也可以顺着相对光滑的双 J 管管壁流入膀胱，排除体外，所以，很多经皮肾镜碎石取石术后都需要根据情况放置一段时间双 J 管。复查CT可以精确判断结石是否残留以及双J管位置等。
CT对于诊断和治疗泌尿系结石有重要意义。 不仅肾结石，泌尿系统其他部位的结石如输尿管结石、膀胱结石和尿道结石等，做CT都是可以查出来的。在绝大多数医院， CT已成为诊断泌尿系结石的常规检查项目。
CT可以发现5毫米以下结石，不仅可以知道结石的大小，还可以清晰地显示结石的部位以及是否有肾积水及积水程度。CT还可以清晰地显示不含钙的结石。另外，通过CT值还能够判断结石的硬度。
肾结石一般先会做B超检查，如果有以下的情况时，才会做CT检查↓↓↓
已经确诊存在有肾脏结石，需要进一步进行手术治疗。通过CT检查更加清楚地了解结石的大小、位置与周围组织的关系、肾脏积水程度，方便设计手术入路。
肠道积气比较多，当B超看不清楚输尿管中下段结石时，可以做泌尿系统的CT检查。
如果结石症状很典型，但B超检查不能发现结石，考虑有微小结石的可能，可以考虑进行CT检查。因为CT扫描可以发现肾脏内2毫米以上的结石，分辨率比B超要更精细。
日常就诊过程中，一般先做简便的B超检查，如有必要时再做CT检查。
检查时最好做整个泌尿系的CT平扫， 检查前半小时请注意先喝水、憋尿、让膀胱及输尿管充盈起来。 扫描过程是很短暂的，如果是多排螺旋CT， 只要1-3分钟 就完成了。