磷脂酰肌醇-3-激酶(Phosphatidylinositol-3kinases,PI3Ks)负责催化细胞内磷脂酰肌醇的磷酸化,在蛋白质合成、细胞增殖、分化、迁移、自噬和凋亡等多种生理功能中发挥着重要作用,与多种肿瘤的发生密切相关。
PI3Ks分为3个亚族,其中Ⅰ亚族的PI3Kδ可介导B细胞的恶性增殖、存活和迁移。
目前,艾代拉里斯(Idelalisib)、杜韦利西布(Duvelisib)、厄布利塞(Umbralisib)和林普利塞(Linperlisib)等PI3Kδ*制剂抑**作为B细胞非霍奇金淋巴瘤(B-NHL)的治疗药物,已获批上市。
然而,靶向PI3Kδ在实体瘤治疗方面的应用研究相对较少。

近期研究表明,PI3Kδ亦是包括乳腺癌、结肠癌、前列腺癌和肝癌在内的多种实体瘤的内在驱动因素。
在乳腺癌细胞中,可观察到PI3Kδ的异常表达,而抑制PI3Kδ可通过干预肿瘤细胞内信号通路及调控肿瘤微环境的双重机制,发挥抗乳腺癌作用。
在前列腺癌以及肝癌发展的过程中,同样可见PI3Kδ的表达逐渐升高,而Idelalisib可发挥显著的体内外抗肝癌效果。
因此,靶向PI3Kδ在治疗实体瘤方面同样具有应用前景。

尽管PI3K*制剂抑**的研发已取得诸多成果,但现有PI3K*制剂抑**均存在疗效不足以及耐药等问题。
单独干预PI3K信号通路,可引起互补信号通路的交叉激活,从而诱发耐药。
组蛋白去乙酰化酶(Histonedeacetylases,HDACs)是表观遗传学中的重要抗癌靶点。
研究表明,PI3K*制剂抑**与HDAC*制剂抑**联合用药不仅可提高疗效,亦能延缓耐药的发生。
较之联合用药,单分子双靶点药物可规避药物间相互作用,简化药物代谢动力学,提升患者的依从性。
目前,基于PI3K泛*制剂抑**和HDAC*制剂抑**分子结构所设计的融合型分子CUDC-907正处于临床研究中。

然而,该化合物由于对PI3K、HDAC均缺乏亚型选择性,毒副作用显著,故临床试验停滞不前,且不适用于实体瘤治疗。
而基于具有PI3Kδ亚型选择性的结构骨架,设计相应的融合型分子,有望解决该问题。
在前期工作中,本团队发现一活性优异的PI3Kδ选择性*制剂抑**TGMXD-208。
该化合物的PI3Kδ结合模式表明,其喹唑啉酮母核的N-3位指向溶剂区,故可供HDAC药效片段的引入。
同时,本团队在开展HDAC*制剂抑**研究的过程中,发现哌啶取代的嘧啶异羟肟酸片段对抑酶活性、ClassIHDAC亚族选择性尤为重要。

因此,本团队拟采用药效团融合策略,将该片段并入TGMXD-208喹唑啉酮母核的N-3位,以发现具有进一步研究价值的新型抗实体瘤喹唑啉酮类化合物。
为验证该类融合型分子抗实体瘤的可行性,我们初步设计、合成了3个结构新颖的喹唑啉酮衍生物,并评价了其对前列腺癌细胞PC-3、乳腺癌细胞MDA-MB-231、乳腺癌细胞T-47D和人脐静脉内皮细胞HUVECs(正常细胞)的增殖抑制活性。
活性筛选结果表明,上述化合物对受试实体瘤细胞株,呈现出显著的体外抗增殖活性,同时对正常细胞的毒性较低。

LY-TP12W12V型分析天平(上海西艾爱电子有限公司);ZF-7型三用紫外分析仪(上海嘉鹏科技有限公司);WB-2000型水浴锅、R-1001VN型旋转蒸发仪、DLSB-5/20型低温冷却液循环泵(郑州长城科工贸有限公司);SHZ-D(Ⅲ)型循环水式多用真空泵、DF-101S型集热式恒温加热磁力搅拌器(河南予华仪器有限公司);AvanceII400MHz型核磁共振仪、OrbitrapExploris120型质谱仪(赛默飞世尔科技公司);三气培养箱(Thermo公司);BertholdLB941型微孔板式多功能酶标仪(Berthold公司)。
二甲基*砜亚**、N,N-二甲基甲酰胺、N,N-二异丙基乙胺、氢氧化钠(分析纯或化学纯,上海安耐吉化学有限公司)。

将4.48g(14.54mmol)化合物9a溶于30mL乙醇中,加入1.78g(44.56mmol)氢氧化钠,升温至80℃回流反应4h。
待反应结束,冰浴下以浓盐酸调至pH7~8,用乙酸乙酯萃取,饱和氯化钠溶液(100mL×3)洗涤,有机相经无水硫酸钠干燥后过滤,滤液浓缩,残留物经硅胶柱层析,得到2.62g白色固体,产率63%。
将0.70g(1.86mmol)化合物10a溶于15mL N,N-二甲基甲酰胺中,加入0.67g(2.05mmol)(1-(5-(甲氧羰基)嘧啶-2-基)哌啶-4-基)甲磺酸甲酯、0.28g(2.05mmol)碳酸钾,升温至60℃回流反应10h。

将0.33g(0.54mmol)化合物11a溶于4mL无水二氯甲烷中,冰浴下加入0.74g(6.48mmol)三氟乙酸,室温反应4h。
待反应结束,冰浴下以饱和碳酸氢钠水溶液调至pH7~8,用二氯甲烷萃取,饱和氯化钠溶液(50mL×3)洗涤,有机相经无水硫酸钠干燥后过滤,滤液浓缩,残留物经硅胶柱层析,得到0.27g白色固体,产率93%。
将0.25g(0.49mmol)化合物12a溶于5mL二甲基*砜亚**中,加入0.08g(0.49mmol)2,4-二氨基-5-氰基-6-氯嘧啶、0.06g(0.98mmol)氟化钾、0.19g(1.47mmol)N,N-二异丙基乙胺,于N2氛围下,升温至90℃回流反应10h。
待反应结束,向反应瓶中加水、静置,析出固体,抽滤,滤饼经硅胶柱层析,得到0.21g白色固体,产率90%。

将0.10g(2.50mmol)氢氧化钠溶于1.5mL羟胺中,冰浴搅拌0.5h后,加入0.20g(0.31mmol)化合物13a、4mL混合溶剂[V(四氢呋喃):V(甲醇)=1:1],室温反应5h。
待反应结束,冰浴下以浓盐酸调至pH7~8,用乙酸乙酯萃取,饱和氯化钠溶液(50mL×3)洗涤,有机相经无水硫酸钠干燥后过滤,滤液浓缩,残留物经硅胶柱层析,得到0.18g白色固体,产率87%。

1HNMR(DMSO-d6,400MHz),δ:11.06(s,1H,OH);9.01(s,1H,NH);8.66(s,2H,Ar—H);7.82~7.78(m,2H,Ar—H);7.68~7.64(m,1H,Ar—H);6.45(s,2H,NH2);6.14(s,2H,NH2);5.64(s,1H,CH);4.76(d,2H,J =13.0Hz,CH2);4.51(s,1H,CH2);4.21(m,1H,CH2);3.94~3.77(m,2H,CH2);3.85(s,1H,CH2);3.00~2.80(m,2H,CH2);2.55(s,1H,CH2);2.09(m,1H,CH);1.96~1.87(m,1H,CH2)1.80(m,2H,CH2);0.64(d,1H,J =6.4Hz,CH2);0.56(m,1H,CH2);0.47(s,1H,CH2);0.20(s,1H,CH2)。
13CNMR(DMSO-d6,100MHz),δ:167.10,165.81,162.50,161.79,161.76,157.59,153.88,140.70,134.14,129.57,127.46,123.63,123.18,120.16,116.05,114.61,112.99,63.44,60.84,49.38,46.68,46.02,43.79,43.72,35.25,19.21,14.42,9.03。
HR-MS,m/z:643.2393[M+H]+。

(S)-2-(4-((5-氯-2-(1-(2,6-二氨基-5-氰基嘧啶-4-基)吡咯烷-2-基)-4-氧代喹唑啉-3(4H)-基)甲基)哌啶-1-基)-N-羟基嘧啶-5-甲酰胺(14b):白色固体,产率83%。
1HNMR(DMSO-d6,400MHz),δ:11.07(s,1H,OH);9.01(s,1H,NH);8.66(s,2H,Ar—H);7.81~7.77(m,2H,Ar—H);7.65(m,1H,Ar—H);6.43(s,2H,NH2);6.09(s,2H,NH2);5.48(d,1H,J =7.7Hz,CH);4.80~4.72(m,2H,CH2);4.50(m,1H,CH2);4.23(m,1H,CH2);4.07~3.97(m,1H,CH2);3.95~3.82(m,1H,CH2);3.06(q,1H,J =7.3Hz,CH2);3.00~2.83(m,2H,CH2);2.35(m,1H,CH);2.15~2.02(m,2H,CH2);2.01~1.91(m,2H,CH2);1.82(t,2H,J =14.2Hz,CH2)。
13CNMR(DMSO-d6,100MHz),δ:167.08,165.66,162.56,161.87,161.75,157.59,153.94,140.71,134.16,129.58,127.45,123.64,123.18,120.07,116.04,114.60,112.91,63.80,60.75,57.07,46.72,43.77,43.69,35.21,28.72,28.36,19.28。
HR-MS,m/z:617.2243[M+H]+。

(S)-2-(4-((5-氯-2-(1-((2,6-二氨基-5-氰基嘧啶-4-基(氨基(丙基)-4-氧代喹唑啉-3(4H)-基)甲基)哌啶-1-基)-N-羟基嘧啶-5-甲酰胺(14c):白色固体,产率80%。
1HNMR(DMSO-d6,400MHz),δ:11.06(s,1H,OH);9.00(s,1H,NH);8.67(s,2H,Ar—H);7.89~7.78(m,2H,Ar—H);7.70(d,1H,J =6.7Hz,Ar—H);6.64(s,2H,NH2);6.60(d,1H,J =8.1Hz,Ar—H);6.43(s,2H,NH2);5.27(t,1H,J =6.4Hz,CH);4.78(d,2H,J =12.5Hz,CH2);4.57~4.40(m,2H,CH2);3.00(t,2H,J =7.2Hz,CH2);2.30~2.18(m,1H,CH2);2.15~2.03(m,1H,CH);1.96(s,1H,CH2);1.92(d,2H,J =8.4Hz,CH2);1.47~1.34(m,2H,CH2);0.84(t,3H,J =7.2Hz,CH3)。
13CNMR(DMSO-d6,100MHz),δ:166.20,165.35,162.47,161.81,157.59,153.27,140.71,134.51,129.75,127.39,123.63,123.18,118.25,116.04,114.63,113.17,60.56,56.25,46.69,43.81,35.49,27.77,19.30,10.18。
HR-MS,m/z:605.2244[M+H]+。

用MTT法检测目标化合物对细胞(PC-3细胞株、MDA-MB-231细胞株、T-47D细胞株、HUVECs细胞株)增殖的影响。
实验步骤如下:将细胞以1×104/孔的密度接种到96孔板中,置37℃、5%CO2培养箱培养过夜。
第2d弃去培养基,加入药物浓度为0.16、0.8、4、20、100μmol/L的含药培养基,每组设3个复孔,孵育96h后,向每个孔中加入20μL的0.5mg/mLMTT溶液,置培养箱中孵育4h后,弃去孔内液体,每孔加入100μL的二甲基*砜亚**,采用酶标仪测得490nm处的吸光度值,并计算抑制率,拟合量效曲线分析数据,得出IC50值。

基于配体/PI3Kδ蛋白复合物晶体结构(PDBcode4EX0)以及配体/HDAC1蛋白复合物晶体结构(PDBcode5ICN),将化合物分别与PI3Kδ以及HDAC1进行分子对接。
去除蛋白晶体内部原始配体和溶剂分子,对蛋白加氢并施加CHARMm力场,得到预处理的分子对接受体。
配体制备完成后,选取原始配体在酶中的位置作为活性位点,完成分子配体的预处理。
应用DiscoveryStudio2020软件中的CDOCKER模块将小分子配体与蛋白受体对接,综合打分函数和相互作用模式选取对接构象。

体外抗增殖活性测试结果表明,所有目标分子对PC-3、MDA-MB-231以及T-47D三种实体瘤细胞株均表现出优异的抗增殖活性,与阳性对照SAHA(上市HDAC*制剂抑**)、Idelalisib相当甚至更优。
较之其他细胞株,目标分子对PC-3细胞株的抗增殖活性最佳。
其中,化合物14a对PC-3细胞株的抗增殖活性最强(IC50为(0.164±0.006)μmol/L),且优于阳性对照SAHA以及Idelalisib。
此外,化合物14a对T-47D细胞株的抗增殖活性较之其他化合物更强(IC50为(3.567±0.161)μmol/L),而化合物14c对MDA-MB-231细胞株的抗增殖活性较之其他化合物更强(IC50为(1.419±0.152)μmol/L)。
较之阳性对照SAHA和Idelalisib,所有目标分子对正常细胞HUVECs的毒性更低,对肿瘤细胞呈现出优良的选择性。
化合物14a、14c对3种细胞株的抗增殖活性均优于两种阳性对照,在后续研究中,将进一步丰富化合物的结构多样性,以获得抗实体瘤活性更优的化合物。

|
Compd. |
Anti-proliferativeIC50/(μmol•L-1) |
|||
|
PC-3 |
MDA-MB-231 |
T-47D |
HUVECs |
|
|
14a |
0.164±0.006 |
4.085±0.611 |
3.567±0.161 |
44.408±8.146 |
|
14b |
0.235±0.002 |
6.392±1.806 |
6.459±0.105 |
41.112±4.345 |
|
14c |
0.203±0.009 |
1.419±0.152 |
4.214±0.079 |
39.414±3.455 |
|
SAHA |
0.329±0.007 |
5.696±0.756 |
9.511±0.533 |
9.267±0.352 |
|
Idelalisib |
5.828±0.042 |
6.754±0.830 |
>100 |
37.634±3.961 |

化合物14a与PI3Kδ的分子对接结果表明,其2,6-二氨基-5-氰基嘧啶结构与铰链区氨基酸残基GLU826和ASP911产生氢键相互作用,同时,与氨基酸残基TYR813产生π-π堆积作用;喹唑啉酮母核位于特异性口袋中,与TRP760产生π-π堆积作用。
此外,连接于喹唑啉酮母核N-3位HDAC药效片段指向溶剂区,未与PI3Kδ蛋白产生空间冲突。
以上结合模式亦有望赋予化合物良好的PI3Kδ亚型选择性。
化合物14a的HDAC1蛋白对接结果表明,其结合模式亦较为合理——异羟肟酸基团可与催化口袋底部的Zn2+配位,并与HDAC1催化通道中氨基酸残基GLY149产生氢键相互作用,而嘧啶环可与HDAC1催化通道中的氨基酸残基PHE150和PHE205产生π-π堆积作用。
综上,化合物14a与PI3Kδ和HDAC1的结合模式合理,有望产生双靶抑制活性。

该研究采用药效团融合策略,以PI3Kδ*制剂抑**TGMXD-208为先导物,通过在其母核的N-3位并入本团队前期发现的HDAC活性片段设计、合成目标分子,并经抗增殖实验,得到3个具有优良体外抗实体瘤活性的喹唑啉酮衍生物。
其中,化合物14a与14c对3种实体瘤细胞株的抗增殖活性均优于阳性对照SAHA和Idelalisib,且对正常细胞毒性较低。
分子对接结果显示,化合物14a与PI3Kδ蛋白以及HDAC1蛋白的结合模式合理,有望产生双靶抑制活性。
以上研究结果初步证实了所设计的融合型分子抗实体瘤的可行性,并为进一步丰富此类分子的结构多样性、开展系统的构效关系研究奠定了基础。