母猪配种输精方式可以分为两种：常规输法和深度输精法。
所谓深度输精就是在常规输精管基础上，搭配一个细软的输精内管，达到将精液直接送入子宫体的目的，又称为子宫颈后人工授精。
而在实际操作中，许多人还是按照常规输精的操作方法来操作深度输精，这是不对的。
比较常见的错误操作是在输精时刺激母猪（包括公猪刺激和人工刺激）和输精时让母猪自己吸入。
深度输精技术的优点在于
1、可以提高母猪受孕率
2、可以节省人工，提高工作效率
3、提高精液利用（深度输精的输精量是常规输精的一半），这样可以提高优良品种公猪的利用率，减少饲养公猪数量，降低成本。
深度输精操作流程
1、查情，以不用人为刺激静立为标准。
2、配种时间
- 和常规输精母猪配种时间不同
- 待配母猪在配种前1小时内不能有公猪或者人工刺激；在配种时不需要公猪接触！
3、清洗，深度输精对卫生要求更加严格。先将母猪外阴使用清水清洗干净，确保没有粪便等脏东西，然后使用一次性纸巾擦干（禁止使用重复性毛巾）；待完全干燥后再输精。
4、插外管，插外管的操作和常规输精法一致。
5、插内管，拿住外管后端，手不能接触内管前端部分；将内管缓慢插入，同时要观察母猪反应，如果母猪有疼痛反应，立即停止，等待30秒再继续操作；如果感觉插入阻力过大，应该是子宫颈没有完全松弛，停止操作，稍等一会再继续，也可以先对下一头母猪进行操作，然后在处理这头母猪。
将外管向里轻轻推，内管保持不动，说明内管插入到位，可以输精。
6、输精，将精液瓶或精液袋接入输精管，然后一手拿住外管，另一只手将精液慢慢挤入，完成输精。
输精过程中如果发生精液倒流，说明内管插入不到位，需要将内管抽出，重新插入；如果倒流严重，需要再输入一份精液，确保输精效果。
7、拔管 输精结束后，将内管连同精液瓶一同拔出，然后将外管抬高，用手刺激母猪外阴30秒，随后顺时针将外管拔出。
8、公猪刺激 输精结束后，可以将公猪放入通道中对母猪进行刺激，促进精液吸收。
深度输精注意事项
1、深度输精不能用于后备和一胎母猪！
2、输精时间和常规输精不同！
3、操作深度输精的员工必须接受培训，细心且耐心！
4、配种时卫生标准更加严格！
5、配种前1小时及配种时都不能刺激母猪，防止子宫颈过紧，内管不好插入！
6、深度输精并不能提高产仔数！