分娩方式对肠道菌群定植的影响，分娩方式对婴儿肠道菌群发展的影响是显著的。顶尖学术期刊《自然》发表的一项新研究证实，在出生后的最初几周内，分娩方式是决定肠道菌群的主要因素。
一次大规模的研究
这一次，英国惠康桑格研究所（Wellcome Sanger Institute）的Trevor Lawley博士带领同事们对英国医院出生的近600名足月婴儿进行了肠道菌群的分析。这些婴儿中，314名经阴道分娩，282名为剖腹产。研究人员希望了解剖腹产会如何影响新生儿期的肠道菌群组成。
分析显示，尽管所有新生儿的肠道菌群在出生一个月内都在变化，但剖腹产婴儿的肠道菌群更不稳定，更容易发生改变。约83%的剖腹产婴儿携带潜在的致病菌，而这一比例在阴道分娩的婴儿中只有49%左右。
阴道分娩儿肠道定植菌源于母体的粪便和阴道环境
自然分娩和母体肠道的短双歧杆菌数量是影响婴儿肠道双歧杆菌定植发展的重要因素。阴道分娩儿肠道菌群定植主要受母亲阴道和会阴区域菌群的影响。
剖宫产儿肠道定植菌主要源于医院环境
包括医院人员的手、医院的空气、仪器设备和接触其他新生儿等。Mikami等研究表明，剖宫产儿分娩过程中接触环境的"过度卫生"，可能减少了母婴间正常微生物群的传递，从而影响了婴儿肠道菌群的定植发展。
剖宫产儿肠道双歧杆菌数量较阴道分娩儿少
双歧杆菌数量少而艰难梭菌等其他菌种数量高，这是因为阴道分娩儿初始定植菌源于母亲的粪便和阴道菌群，而剖宫产儿初始定植菌源于医院环境。
剖宫产儿菌群的建立是延迟的
与阴道分娩儿比较，剖宫产儿肠道类杆菌、双歧杆菌和大肠杆菌定植延迟，同时达优势化时间较迟。
剖宫产可能与一些疾病相关
通过阴道分娩可促进新生儿免疫系统细胞因子的产生，而剖宫产等非自然因素的存在可以改变或延迟新生儿肠道菌群的早期定植并增加特异性疾病的发生率。
临床可以观察到，剖宫产儿更易发生腹泻和食物过敏，剖宫产可能还与儿童哮喘、过敏等疾病发展有关，这应该是由肠道微生物结构的变化引起的，这还有待进一步研究，但无疑是一个值得关注重要的问题。