nature如何分析菌群 (妇科菌群科普)

妇科菌群科普,nature肠道微生物封面

妇科菌群科普,nature肠道微生物封面

03 月 25 日的《母婴之声》,我们解读了 10 篇文献,关注:阴道菌群,更年期,母乳微生物,HPV感染,GBS,肠道菌群,肠道免疫,益生菌,肥胖。 ​​

Nature子刊:一文+一图读懂阴道菌群(综述)

Nature Microbiology——[17.745]

① 阴道菌群中以乳杆菌属为主,但其中卷曲乳杆菌被认为是具有最大的有益作用,而惰性乳杆菌的有益性最低;② 以其他兼性/专性厌氧菌为主的阴道菌群可能与阴道炎或无症状阴道炎有关,但其是否需要治疗、何种群落结构应该治疗仍存争议;③ 影响阴道菌群的因素并不完全清楚,种族、年龄等是公认的影响因素;④ “不良”的阴道菌群结构可能与性传播疾病(如HIV、淋病、衣原体、滴虫、单纯疱疹病毒、HPV)及宫颈内瘤变等的发生有关。

【主编评语】

阴道微环境与女性健康的关联巨大,发表在《Nature Microbiology》上的这篇综述详细总结了阴道菌群的特点、与疾病的关联、潜在影响因素、潜在干预措施以及未来研究的方向,是值得一读的深度好文。作者提到,前期大量流行病学证据已经揭示了很多关于阴道菌群及其与宿主健康的关系,但不幸的是,我们对观察性研究和基于测序数据的分析并不能展示其中具体机制的探讨。这些观察性研究产生了很多的科学假说,都需要在实验室进一步检验。因此,亟需一个包含阴道菌群的宫颈阴道模型,并整合基因组学、转录组学、代谢组学和免疫组学的数据开展研究。(@Epi汪)

【原文信息】

Towards a deeper understanding of the vaginal microbiota

2022-03-04, doi: 10.1038/s41564-022-01083-2

Nature子刊:一文+一图读懂阴道菌群与更年期健康(观点)

Nature Microbiology——[17.745]

① 女性一生中阴道微生物群落结构不同,青春期前阴道菌群多样性较高,pH呈中性到碱性,青春期以几种乳杆菌为主,而绝经期随着雌激素水平下降,乳杆菌丰度降低;② 绝经期阴道中的乳杆菌定植可以直接或间接地促进女性健康;③ 肠道菌群代谢过程影响循环系统中雌激素水平,从而可影响阴道菌群,因此存在“肠道-阴道轴”;④ 此外,“阴道-膀胱轴”影响了女性膀胱中的乳杆菌,与绝经期预防泌尿生殖道感染密切相关。

【主编评语】

随着人口老龄化问题的加快,女性更年期健康问题成为重要的公共卫生问题;其中更年期中常见的反复阴道炎症状、睡眠和情绪问题等,困扰着诸多女性。发表在《Nature Microbiology》上的观点评论文章总结了女性不同时期阴道菌群的特点,阐明了阴道-肠道菌群之间的关联,并指出其对中枢神经系统的潜在作用,在缓解更年期女性睡眠、情绪问题中的价值;此外,通过肠道菌群作用,可能对体内激素水平产生影响,从而进一步影响阴道菌群。而阴道菌群靶向疗法的进步,为阴道菌群干预提供了可能。(@Epi汪)

【原文信息】

Connecting microbiome and menopause for healthy ageing

2022-03-04, doi: 10.1038/s41564-022-01071-6

关注母乳中微生物代谢物(综述)

Trends in Microbiology——[17.079]

① 最新的证据表明,母乳中存在微生物代谢产物,这些代谢物可能影响婴儿的生长发育;② 其中单链脂肪酸是预防或调节特应性肥胖等非传染性疾病的关键分子;③ ILA可能是婴儿肠道或乳汁双歧杆菌产生的一种重要的吲哚,对健康具有重要意义;④ 母乳中可能检出TMA,提示了这种肠道产生的代谢物被转运到母乳动物乳腺的潜力,并且该物质可能与心血管疾病有关,包括胰岛素抵抗、脂肪肝、动脉粥样硬化等;⑤ 应有更多的研究关注母乳中的微生物代谢物。

【主编评语】

母乳成分被认为是影响婴幼儿健康的关键因素,一直备受关注。近来的研究证据表明,母乳中含有微生物的代谢产物,这其中一方面可能与肠道代谢物的转运有关,另一方面可能与乳房局部菌群有关。但无论如何,母乳中的微生物及其代谢物或成为新生儿健康研究的下一个风口。(@Epi汪)

【原文信息】

Microbial metabolites: the next frontier in human milk

2022-03-10, doi: 10.1016/j.tim.2022.02.007

国内团队:HPV感染与阴道菌群结构改变存在关联

Journal of Translational Medicine——[5.531]

① 招募100名女性,其中28人高危HPV持续感染(P组),30名女性高危HPV清除(C组),而42人没有感染史(NC组),检测阴道菌群结构;② PCoA分析提示NC组与P/C组阴道菌群结构存在差异;③ P组和C组阴道菌群中厚壁菌门、放线菌门丰度增高,而变形菌门丰度降低;④ 从Chao1指数来看,NC组阴道菌群丰度高于C组;⑤ C组的双歧杆菌和乳酸菌丰度高于NC组,提示这两种菌对阴道微生物的调控可能参与HPV的清除。

【主编评语】

阴道高危HPV感染已被证实是宫颈癌发生的危险因素。既往有研究认为,可以通过阴道菌群管理预防HPV感染,但并没有被证实。本研究发现,HPV感染和阴道菌群之间存在密切关联,并且阴道菌群中的双歧杆菌和乳酸杆菌可能参与到阴道中HPV的清除过程中。(@Epi汪)

【原文信息】

Dysbiosis of vaginal microbiota associated with persistent high-risk human papilloma virus infection

2022-01-03, doi: 10.1186/s12967-021-03201-w

减少女性阴道中B组链球菌定植,人乳寡糖或是利器

mSphere——[4.389]

① 通过体外人类阴道上皮细胞和小鼠阴道模型,发现人乳低聚糖(HMO)对B组链球菌(GBS)活性具有强大的抑制作用;② 但HMO干预并不会改变GBS或鼠李糖乳杆菌对人类阴道上皮细胞的粘附力;③ 在体内研究中,HMO干预减少了阴道GBS负担,但对阴道菌群的改变很小;④ HMO对GBS的作用靶点可能是糖基转移酶san_0913,敲降san_0913后的GBS可逆转HMO对其活性的抑制,但是并没有影响GBS在阴道上皮细胞的黏附、定植以及生物膜的形成。

【主编评语】

B组链球菌在健康女性阴道粘膜上也常被检出,被认为是新生儿感染的主要原因之一。虽然抗生素可以在一定程度上“杀死”阴道中的致病菌,但是其也可能会破坏正常的阴道菌群结构。本研究创新性地发现了人乳寡糖在阴道菌群中的独特作用,既可以降低GBS的活性,又不影响其他正常阴道菌群,具有巨大的临床应用前景。(@Epi汪)

【原文信息】

Human Milk Oligosaccharides Reduce Murine Group B Vaginal Colonization with Minimal Impact on the Vaginal Microbiota

2022-02-23, doi: 10.1128/msphere.00885-21

国内团队:环境污染物通过肠道菌群影响儿童行为发育

Science of the Total Environment——[7.963]

① 让孕期/哺乳期的母鼠暴露于低剂量的四溴二苯醚(PBDE47),发现子代幼鼠出现多动和焦虑行为;② 此外,幼鼠的肠道菌群结构发生明显变化,表现在瘤胃菌科、莫拉氏菌属丰度下降,而链球菌科、Deferribacteraceae、大肠杆菌、假单胞菌以及球菌属丰度增高;③ PBDE47暴露后血液代谢组学发生明显改变,体现在氨基酸、碳水化合物、核苷酸、外源性物质和脂质代谢等途径变化;④ 肠道菌群的改变和血清代谢物改变相关,且与神经行为障碍有关。

【主编评语】

自从“肠脑轴”被阐明以来,许多影响儿童神经/行为发育的环境污染物都被发现可能通过影响肠道菌群,而后对儿童发育造成影响,肠道菌群成为重要的中介变量。类似地,本研究发现四溴二苯醚也可能通过影响肠道菌群,进而影响血清代谢组,最终导致儿童出现多动、焦虑样行为。本研究为环境污染物防控提供了科学依据。(@Epi汪)

【原文信息】

Perinatal exposure to low-level PBDE-47 programs gut microbiota, host metabolism and neurobehavior in adult rats: An integrated analysis

2022-02-23, doi: 10.1016/j.scitotenv.2022.154150

肠道菌群与免疫因子共同维护早产儿肠道发育

Frontiers in Immunology——[7.561]

① 纳入40名孕期小于33周早产儿,检测粪便细胞因子和肠道菌群;② 肠道菌群结构与肠道通透性、母乳喂养和免疫组学存在关联;③ 其中表皮葡萄球菌和肠杆菌丰度与通透性增高、母乳喂养减少以及细胞因子谱变化存在关联;④ 此外,通透性降低与粪便中IL-1α/β水平增高有关,其菌群中厌氧菌丰度增加;⑤ 免疫和微生物因素在肠道屏障的早期发育中起着至关重要的作用,它们共同塑造了肠道微环境,影响着早产儿的肠道稳态和肠道成熟。

【主编评语】

肠道屏障不成熟,容易导致肠漏发生,是早产儿易患坏死性小肠炎的病因。肠道免疫反应加剧、肠道菌群失调和屏障损伤加剧被认为是生命早期肠道的主要诱因。过度的宿主免疫有助于这一过程,但确切的因素并未被阐明,在肠道成熟的生物学基础上留下了重大的知识空白。因此,本研究通过对40例早产儿的肠道菌群检测,揭示了肠道菌群、免疫因子与肠道通透性、母乳喂养行为等因素之间的关联。(@Epi汪)

【原文信息】

Altered Gut Microbiome and Fecal Immune Phenotype in Early Preterm Infants With Leaky Gut

2022-02-26, doi: 10.3389/fimmu.2022.815046

儿童食物过敏很头痛,产前益生元或有益

Frontiers in Immunology——[7.561]

① 利用动物模型研究发现,在妊娠期补充益生元(半乳寡糖/菊粉)可以促进母体粪便菌群中有益菌的增多,并在哺乳期促进益生菌的存在;② 这种菌群的改变,可以被转移到后代,并维持到成年期;③ 干预组后代小鼠B和T调节免疫细胞亚群增加,增加Th2反应,提示形成耐受性的免疫环境;④ 同时,实验观察到干预组后代小鼠减轻了小麦过敏的症状;⑤ 产前补充益生元或可降低后代食物过敏的风险。

【主编评语】

婴幼儿的食物过敏问题困扰着诸多的家长。本研究通过动物实验发现,母亲在产前摄入半乳寡糖/菊粉可以在一定程度上降低子代食物过敏的风险。半乳寡糖和菊粉可以促进耐受性、强化上皮屏障并调节肠道微生物,因此或可应用在预防儿童食物过敏的干预策略中。(@Epi汪)

【原文信息】

Prebiotic Supplementation During Gestation Induces a Tolerogenic Environment and a Protective Microbiota in Offspring Mitigating Food Allergy

2022-01-05, doi: 10.3389/fimmu.2021.745535

PNAS:益生菌或可降低母亲肥胖导致的儿童情感障碍

PNAS——[11.205]

① 长时间高脂饮食喂养降低母鼠肠道短链脂肪酸的丰度,增加外周炎症的标志物,并降低母乳中神经活性代谢物的丰度;② 肥胖母鼠的后代,无论是幼鼠还是成鼠,都表现出更多的焦虑样行为,但可以通过围产期服用益生菌来预防;③ 母鼠益生菌治疗增加了子代肠道丁酸和脑乳酸,并增加了前额叶皮质PFKFB3的表达,PFKFB3是星形胶质细胞糖酵解代谢的标志;④ 母亲肥胖降低了子代突触素的表达,而围产期益生菌治疗可增加脑源性神经营养因子的表达。

【主编评语】

母亲的肥胖可能增加子代情感障碍的发生风险。本研究通过系统的动物实验设计,发现肥胖母亲通过益生菌治疗可以在一定程度上改善子代的行为问题。其中的重要机制是肠道菌群代谢物的改变通过肠脑轴影响神经系统发育。因此,益生菌在预防儿童行为问题的发生上具有较大的价值。(@Epi汪)

【原文信息】

Modifying the maternal microbiota alters the gut–brain metabolome and prevents emotional dysfunction in the adult offspring of obese dams

2022-03-01, doi: 10.1073/pnas.2108581119

揭秘孕期肥胖如何影响子代心血管健康

eLife——[8.14]

① 利用小鼠模型发现,孕期饮食引起的肥胖对母体和胎儿的血清脂质组成和脂肪酸代谢产生的影响具有差异,并且可以影响子代心脏的形态;② 相比于雄性胎儿,雌性胎儿心脏脂质组对母体肥胖因素更加敏感;③ 脂质供应的变化可能有助于暴露于母体肥胖的小鼠心脏中脂肪分解基因的早期表达,以促进脂质代谢;④ 胎儿心脏中丰富的酰基肉碱与母体肥胖有关;⑤ 胎儿心脏对子宫内环境暴露的反应存在性别差异,母体肥胖可影响后代心血管健康。

【主编评语】

在孕期控制增重,避免肥胖具有诸多好处。本研究通过动物实验,证实孕期母亲肥胖可能影响子代脂代谢和脂质组,进而影响心脏健康。因此,孕期控制饮食尤为重要。(@Epi汪)

【原文信息】

Maternal diet-induced obesity during pregnancy alters lipid supply to mouse E18.5 fetuses and changes the cardiac tissue lipidome in a sex-dependent manner

2022-01-13, doi: 10.7554/eLife.69078

感谢本期日报的创作者:Epi汪,尹小甜

点击阅读过去5天的日报:

03-18 | Science剑指内分泌干扰物,助力儿童发育风险评估

03-11 | HPV如何祸害阴道菌群?Nature子刊详探机制

03-04 | JAMA疾呼:围产期事件关乎女性一生健康

02-25 | 赵方庆等大数据揭示:从阴道菌群看孕产期健康

02-18 | 宿主免疫如何调控阴道菌群?14分研究深入阐述