佛珠的制作过程是一个复杂的流程，其中包括：
第一阶段：设计构思
在这个阶段中，首先我们要先绘制一张设计构思图，将珠子的大小、纹理的朝向、孔洞的大小、三通和隔珠的差量、佛塔的造型、串珠的绳线、吊坠及配饰、编造的样式、佛珠的整体效果等问题规划清晰，在加工前有一个明确的框架，这是制作出一条如法而美观的佛珠的首要环节。
第二阶段：选料和开料
在这个阶段是进行原材料的挑选，根据设计图计算出所需原料的尺寸规格，依待加工佛珠的不同档次选择不同档次的材料，要注意材料的成本，不要大材小用。选择一块或几块材料，利用锯等切割工具将大料破成小块壮或条状，开料要根据后加工机器的需要，不要造成材料的过度损耗。
第三阶段：定样成形
这一过程中，我们要使用不同的工具或机器设备，将前一阶段开好的原料，进行消磨、滚圆、成球的操作，把佛珠的大体雏形一颗颗磨制出来，在这个过程中一定要控制好珠子的大小规格，保证整串珠子的形体一致。
第四阶段：打磨抛光
此时，将切削定型好的圆珠拿来，进行手工或机械打磨抛光，将表面的毛刺棱角、刀印刀痕统统磨掉，再用水抛、腊抛、或布抛等抛光方式将珠子表面抛光，大批量的珠子多使用震荡筒或滚筒，加上抛光用的磨料进行抛光，抛光一定要掌握力度和时间，避免因为过度抛光造成规格损耗。
第五阶段：打孔穿孔
这是佛珠制造的关键环节，佛珠的整体感觉的好坏，就取决于孔打的是否端正统一，手工打孔要找准珠子的中心，下钻要稳，力度要平均。机器打孔要规矩的多，但精品多出自手工，有些木珠机械在定型的阶段就已经把孔打好了，可以省去这个环节。
第六阶段：配饰编结
到此就要进行画龙点睛的工作了，将做好的珠子贯穿的方式，选择好相应的隔珠与配饰，用结实的绳线将子珠隔珠穿好，再使用专用的引线或工具串过三通和佛塔，剩下就是要将配饰编在绳结上，绳结的款式根据佛珠的功能而定。
第七阶段：包装与开光。